ショコラ
JavaScript（JScript）でファイルを書き込むには？
ActiveXObject の Scripting.FileSystemObject でキメマス。
もっさん先輩
var fs = new ActiveXObject('Scripting.FileSystemObject');
var file = fs.OpenTextFile(｛書き込むファイル｝,2,true,0);
file.WriteLine(｛書き込む内容｝);
file.Close();OpenTextFileメソッドの説明：2:ファイルを書き込み専用として開きます。0:Ascii 形式でファイルを開きます。
例
var fs = new ActiveXObject('Scripting.FileSystemObject');
var file = fs.OpenTextFile('CSV2XLS.reg',2,true,0);
file.WriteLine('REGEDIT4');
file.WriteLine('[HKEY_CLASSES_ROOT\htafile\ShellEx\DropHandler]');
file.WriteLine('@="{60254CA5-953B-11CF-8C96-00AA00B8708C}"');
file.Close();